我院肛肠科始成立于1979年4月，原为“痔瘘科”，1980年2月市中医院成立时更名为“肛肠科”。1998年由住院部普通外科独立，成立肛肠科。是以收治肛门大肠疾病为主的临床诊治科室，也是我市市级医疗单位中唯一专科设备集中、诊治肛门大肠疾病种类较多的中西医结合肛门大肠病专科。肛肠科于2010年创建为南充市中医重点专科，2013年申报为省级中医重点专科建设单位。建设成为南充市中医重点专科以来，积极引进和运用新技术，加强人才培养，扩大业务范围，拓宽服务领域，改善就医环境。于2016年10月通过了四川省中医重点专科评审工作。
我院肛肠科以传统的中医学配合现代的中西医结合治疗方法，诊治各种类型的肛门大肠疾病。近年来，我院肛肠科由单纯的混合痔、肛瘘、肛裂、肛周脓肿等传统手术，发展到腹腔镜下结直肠癌、胃癌的微创治疗及术前新辅助、术后化疗，混合痔、肛瘘、肛裂、直肠前突、直肠脱垂等的微创治疗，结直肠息肉的内镜介入治疗及腹腔镜—肠镜双镜联合较大结、直肠息肉微创切除，阑尾、胆囊、腹股勾疝经腹腔镜的微创治疗。
2010年，在新桥医院张朝军教授指导下开展我院首例腹腔镜直肠癌根治术，2015年5月，在南充市中心医院胃肠外科杨主任的指导下开展阆中市首例高龄老人（85岁），腹腔镜下直肠癌根治术，2016年5月，独立开展我院首例腹腔镜直肠癌根治术并取得成功，这也是阆中市首例全电钩中高位直肠癌根治术。自2017年2月起，腹腔镜直肠癌已成为我院治疗直肠癌的常规手术，已成功开展18例，无一人发生吻合口漏、吻合口狭窄愈合不良等并发症；2017年3月，开展阆中市首例腹腔镜—肠镜双镜联合结肠息肉切除术，目前已开展6例，效果良好；2017年4月，开展阆中市首例腹腔镜辅助脾切除术。目前，腹腔镜胆囊切除术、腹腔镜阑尾切除术、腹腔镜下腹股沟疝修补术等已形成常规手术，大大减轻患者痛苦，平均住院日从以往6日缩短至3日。
目前，微创外科、精准外科已经成为时代的需要。腹腔镜手术因其创伤小、恢复快、并发症少等特点，正在逐步替代传统的开放性手术，成为新的标准化治疗手段。腹腔镜手术，开展难度较大，打破了传统的经腹切口开刀术式，克服了传统术式切口大、疼痛明显、术后恢复慢、并发症多的缺点。此类手术在我院的的常规开展，标志着我院肛肠科医疗水平达到了一个新的高度。我院肛肠科将进一步加大专业人才培养力度，加大科研经费投入，形成团队合力，在新的时期砥砺前行，使传统的“小肛肠”向现代化“大肛肠”发展。
